● 管理機構
（1）辦公室
負責綜合事務管理協調，組織起草綜合性文件、規章制度和中心年鑒；督辦上級機關和領導交辦的工作事項；負責中心綜合性會議的計劃和管理；承擔文秘、宣傳、外事、辦公自動化、政務信息、目標考核、政策法規、應急管理、安全保衛、綜合治安、保密、檔案、信訪、接待等工作；負責中心房屋、基建等行政后勤管理工作。
（2）業務科技處
負責業務運行、服務和科研工作的組織管理；負責編制業務發展的年度計劃、目標考核指標并組織實施；負責組織業務運行流程的設計和實施，組織制定業務運行管理規章制度、考核辦法、獎懲辦法并監督實施；組織編制業務技術規范、歸口管理業務技術標準化工作；負責協調與區域中心、省級部門的業務技術事宜；負責業務應急的組織管理。負責大中型業務建設項目、重大工程建設項目的組織管理與協調、項目驗收等工作；負責科學研究、技術開發活動的組織管理，制定、落實科研成果向業務轉化的計劃和措施。承擔國家氣象基本信息標準化委員會秘書處、氣象通信與信息技術委員會秘書處、國家氣象信息中心科學技術委員會辦公室的工作。負責消耗用品采購、出入庫管理等。
（3）計劃財務處
負責中心的財務管理；編制中心的財務預算和決算；組織制定中心的年度財務計劃；負責中心的財務結算；負責各項經費使用的管理與監督；承擔各項財務統計報表的編制、上報工作；負責歸口管理中心建設項目的立項；負責中心國有資產的統計與管理；制定財務管理規章制度并監督執行；負責定期編報中心各項財務執行情況和財務狀況分析報告。
（4）人事處
負責干部選拔、考核及任免事宜；負責中心機構設置和人員編制工作；制定人事管理規章制度；負責辦理中心處、科級干部人事任免事宜；負責中心的人員調配、招聘工作；負責制定中心職工教育與培訓計劃及教育培訓工作的組織和管理；負責訪問學者的計劃與管理；承辦干部專業技術職稱評聘和工人等級考核等事務；負責勞動工資管理及其相關的報表統計；負責職工有關社會保險及各項福利工作的相關事宜及管理；負責中心出國人員的政審工作；承擔對人才交流站的管理。
（5）黨委辦公室（監察審計室）
負責黨的建設與黨員發展及日常黨務管理工作；負責黨的宣傳活動及對黨員的教育工作；負責干部、職工的思想政治工作，組織落實精神文明建設；負責黨風廉政建設和紀檢、監察工作；負責對財務情況、基建工程項目、政府集中采購等內部審計和監督；負責工會、共青團、婦女工作；起草黨建和監察審計方面的文件和規章制度；負責干部選拔監督和干部離任審計；完成上級機關和中心黨委交辦的工作事項。
（6）退休干部辦公室
負責退休人員的管理和服務工作。負責擬訂退休干部工作及服務管理相關辦法，并組織實施；組織退休干部參加政治學習活動，協助退休干部基層黨組織開展工作；組織退休干部開展文體活動。
● 業務機構
（1）運行監控室
負責氣象通信（廣域網絡、局域網絡、INTERNET、衛星廣播、國內外通信系統）、高性能計算、數據存儲管理與服務（數據庫、門戶網站）、電視會商等實時業務系統的統一運行監視、控制、日常運行維護；負責實時業務變更、應急業務實施和業務運行質量統計；承擔電視會商、運行監控等相關業務系統建設和管理；負責機房安全監視和管理。參與局域網和INTERNET網的建設，承擔網絡應用系統的開發和用戶技術支持；負責機房內各種托管技術系統的運行監視。參與業務項目、工程建設項目業務驗收測試及驗收工作。負責制定相關業務系統技術規范，承擔對全國的業務技術指導工作。
（2）通信臺
承擔國際氣象通信、國內氣象通信、省際數據共享等業務系統的建設和技術支持；承擔WMO RTH/GISC職能及相關領域國際合作技術工作；承擔全國地面廣域網、衛星數據廣播、應急通信等業務系統建設、技術支持；承擔預警信息發布業務建設和技術支持；負責相關通信業務新增功能的開發；負責相關業務系統信息安全規范制定和實施管理；負責制定相關業務系統技術規范，承擔對全國的技術指導工作。
（3）高性能計算室
承擔國家級高性能計算系統建設、維護和用戶支持；負責國家級公共存儲系統建設和技術支持；承擔數值預報國家級存儲系統的建設和技術支持；負責并行計算技術研究與應用，承擔數值預報模式并行計算與支持服務；負責數值預報模式系統相關的支撐軟件系統的建設和用戶支持；負責數值預報產品的存儲管理、服務和用戶支持；負責氣象部門計算資源整合和共享系統的建設和管理，負責實施資源分配管理；承擔局域網和INTERNET網的建設和技術支持；負責相關業務系統信息安全規范制定和實施。承擔“北京高性能計算機應用中心”的職能；負責制定相關業務系統技術規范，承擔對全國的技術指導工作。
（4）資料服務室（中國氣象局氣象檔案館）
負責數據存儲管理、數據服務及用戶技術支持；開展數據質量控制及數據質量評估業務；負責數據目錄整理和維護；負責氣象資料整理和歸檔管理，負責歷史資料數字化工作；負責基礎地理信息管理、服務及用戶技術支持。承擔數據存儲管理和服務系統建設、運行，承擔長時間序列數據產品自動制作工作。負責世界數據中心氣象學科中國中心建設和運行。承擔全國氣象資料管理與服務技術指導工作。承擔中國氣象局氣象檔案館的工作。
（5）氣象數據研究室
承擔氣象資料質量控制、評估方法及應用技術研究，負責資料標準格式制定和應用解釋；跟蹤國內外氣象資料加工處理新技術，負責氣象數據的加工處理、數據分析算法研究，承擔數據產品研制及試驗評估；開展氣候資料均一性檢驗、資料插補和序列訂正以及氣候資料整編；開展多源資料融合處理技術研究，研制高級數據產品加工算法；負責氣象資料業務的技術指導工作。
（6）電子政務處
擬訂氣象部門電子政務建設規劃，指導全國氣象部門電子政務建設工作；承擔中國氣象局機關電子政務系統建設、維護和管理工作；歸口管理氣象部門政務信息化工作。
（7）系統工程室
牽頭組織氣象信息技術、氣象信息科學等重大前沿科技問題預研，負責全國氣象部門氣象信息系統發展戰略研究，提出相關的發展規劃；牽頭重大信息網絡系統項目建議書、可行性研究報告、初步設計等編制以及信息系統安全體系；擬定重大工程建設項目實施方案，提出系統集成、聯調測試、系統驗收等技術方案，組織擬訂設備（軟件）采購技術要求；負責項目實施過程中的技術協調、質量監督和技術把關。
（8）業務與園區電訊保障室
承擔機房場地、電力、空調、照明、消防等系統建設、運行監控，以及大樓電力、供水、照明等環境設施的維護；負責局公用電視、程控電話、園區因特網等資訊系統建設、運行及用戶技術支持；承擔大院通信管道維護、管理等工作。
